北海道警方内部合伙伪装发票，并借此将大量搜查费等公款收入私囊。警部方面对此矢口否认，为了探明真伪，政府组成了以现任警察证词为佐证“百条委员会”。针对警察内部腐败的委员会，定于10月23日上午十点召开。然而，就在那之前，一起凶案发生了。
　　22日上午八时，札幌市一所公寓内，发现一具女尸。大通署的町田（野村祐人 饰）与岩井（伊藤明贤 饰）前往现场，确认了死者身份等信息。死者系北海道警方生活安全企划课的原巡警水村朝美，死亡推定时间为21日夜里十一点半，被害者双手上还拷有北海道警方手铐。
　　北海道警方本部的石冈刑警部长（鹿贺丈史 饰）等人赶到现场，高层领导电影下载的异常举动，令町田与岩井的心中产生了疑惑。
　　大通署刑事第一课，大家都在讨论着第二天将召开的百条委员会。返回警署的町田与岩井，汇报了水村巡警谋杀案的情况。听说案发现场极有可能是警方本部的搜查据点后，所属第一课的警官佐伯（大森南朋 饰）表情凝重了起来。
　　下午一点，水村的前任男友北海道警察津久井巡警，被当作水村受害一案的嫌疑犯，目前，津久井下落不明。
　　随即，警方本部成立了水村杀害事件搜查本部，因现场搜集到实弹及少量兴奋剂，上级下达了对嫌疑犯津久井直接射杀的命令，同时，出动了特殊犯搜查队SIT。而此时，警方还未掌握任何可以证明津久井就是凶手以及其使用毒品的证据。这一非同寻常的命令，让佐伯陷入沉思中。
　　当晚，佐伯将大通署的小岛（松雪泰子 饰）等人汇集到“BLACK BIRD”酒吧，这所酒吧的老板原来也是警察，是佐伯的朋友。
　　佐伯、小岛、新宫（忍成修吾 饰）、町田、岩井、植村（萤雪次朗 饰）等大通署第一课的主要成员，全部聚集在“BLACK BIRD”，他们认为水村杀害事件与明天的百条委员会相关联。这时，被通缉的津久井（宫迫博之 饰）从酒吧后面走了出来，他是被传作明天早上的百条委员会的证人。
　　为查清真相，佐伯等人决定分头行动。町田与植村再次前往案发现场；新宫与岩井将自称无罪的津久井送往酒吧老板的家中；佐伯于小岛留在酒吧，进入本部网络，调查水村的人际关系。
　　町田与植村发现案发现场消失了的液晶电视，出现在了旧货店中，而出现在旧货店的男子，是有前科的人，他成为了杀害水村的重要嫌疑犯。离百条委员会的召开只剩下几个小时了，佐伯的时间不多了。
　　23日上午十点，百条委员会准时召开。津久井能否作为证人出现呢？警方本部是否为封口而命令射杀津久井的呢？事情的发展出乎佐伯的意料……